1、承包合同的主体不同。
分包合同的主体双方是总承包人与分包人，分包承包人在总承包合同关系中，仅处于第三人的位置。而转包是将原承包合同的主体双方变更为发包与受让方，原承包合同的承包方则退出承包合同，使得受让人取代承包方成为原承包合同的一方当事人。
2、权利、义务内容不同。
分包合同是总承包人与分包人之间形成的承包合同，其权利、义务由双方当事人约定。转包在转让后原承包合同的内容保持不变，仅主体发生了变更，受让人直接享有原承包合同的权利和义务。
3、法律后果不同。
我国法律允许建设工程总承包方经发包方认可或者总承包合同中明确约定可以将承包工程中的部分工程发包给具有相应资质条件的分包人。依法成立的分包合同具有法律效力。对于转包行为，法律明确规定予以禁止。
【本文关联的相关法律依据】
《建设工程质量管理条例》第七十的规定违法分包，是指下列行为：(一)总承包单位将建设工程分包给不具备相应资质条件的单位的；(二)建设工程总承包合同中未有约定，又未经建设单位认可，承包单位将其承包的部分建设工程交由其他单位完成的；(三)施工总承包单位将建设工程主体结构的施工分包给其他单位的；(四)分包单位将其承包的建设工程再分包的。《最高人民关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第一条、第四条、第五条规定，虽然建设工程发包人将工程项目发包给超越资质等级的承包人，属于违法分包导致建设施工合同无效的情形，但只要承包人在建设工程竣工验收前取得相应的资质等级，当事人请求按照无效合同处理的，不予支持。由此可知，违法分包并不直接导致建设施工合同无效。《最高人民关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第第四款，当存在建设工程转包、违法分包情形的，发包人均可请求解除合同（此处的合同应是发包人与非法转包人或违法分包人签订的合同）。由此产生的是法定合同解除权，但解除之前的合同仍然有效。